El patronato es el máximo órgano de gobierno de la Fundación y está asistido en sus funciones por el Patronato de Honor, cuya finalidad es la de intervenir como órgano consultivo del Patronato.
El Patronato de Honor está constituido por todas aquellas personas que hayan ejercido el cargo de Presidente de la Sociedad Española de Psiquiatría, de la Sociedad Española de Psiquiatría Biológica o de la Sociedad Española de Psiquiatría y Salud Mental, así como aquellas personas físicas y jurídicas, tanto nacionales como extranjeras, que sean designadas por el Patronato en consideración a su prestigio profesional en relación con la Psiquiatría, la Salud Mental y sus ciencias afines o en reconocimiento a su labor y esfuerzo en proteger, apoyar y difundir dichas ciencias.